题目: 解密AlphaFold2-从蛋白从头折叠方法RaptorX谈起
开发者、前腾讯AI-Lab高级专家)
时间: 4月1日(星期四)上午10:30-11:30
地点: 西区生物楼531室
摘要:去年12月初,相信大家的朋友圈都被DeepMind的AlphaFold2(AF2)给刷屏了,因为AF2在具有“蛋白质奥林匹克竞赛”之称的第14届国际蛋白质结构预测大赛(CASP14)上横扫全部参赛选手,以异常夸张的结构预测精度令世人震撼。DeepMind表示,AF2基本解决了蛋白折叠问题这个困扰人类50年之久的问题。《自然》杂志在随后的评论更是称AF2“将改变一切”。那么,AF2究竟是什么?它是如何一步步进化到如此高的精度的?有哪些底层逻辑是值得我们深入思考的?我将给出自己的见解,一切从第一代基于深度学习的蛋白从头折叠方法RaptorX谈起。
报告人简介:王晟博士,2005年毕业于上海交通大学生命科学院,2010年于中国科学院理论物理所取得博士学位,之后分别在TTIC,芝加哥大学以及KAUST从事Research Scientist工作。2019 年回国后,在腾讯 AI Lab 担任高级研究专家。王晟博士主要从事基于人工智能的计算生物学研究,尤其是基于深度学习的蛋白质结构从头预测,达到了国际先进水准(CASP12/14蛋白接触图预测第一名)。近五年来,王晟在PNAS, Cell Systems, Nature Protocols, Nucleic Acids Research, Genome Biology, Bioinformatics, Brief. in Bioinform., PloS Comp. Biol.等国际知名期刊上发表论文60多篇;会议论文近30篇,包括计算生物的知名会议ISMB, RECOMB, ECCB等,以及计算机视觉领域知名会议CVPR等。Google Scholar引用接近4200次,h-index为27。
报告邀请人:刘海燕教授